一種位于poly(A)位點(diǎn)下游，長(zhǎng)度在數(shù)百堿基以內(nèi)的結(jié)構(gòu)。 在原核中，發(fā)現(xiàn)終止信號(hào)存在于RNA聚合酶已經(jīng)轉(zhuǎn)錄過(guò)的序列之中。這種提供終止信號(hào)的結(jié)構(gòu)就稱為終止子。

終止子可分為兩類。一類不依賴于蛋白質(zhì)輔因子就能實(shí)現(xiàn)終止作用。另一類則依賴蛋白輔因子才能實(shí)現(xiàn)終止作用。這種蛋白質(zhì)輔因子稱為終止因子，通常又稱ρ因子。 兩類終止子有共同的序列特征。在轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)前有一段回文序列。回文序列的兩個(gè)重復(fù)部分(每個(gè)7～20bp)由幾個(gè)不重復(fù)的bp節(jié)段隔開(kāi)?；匚男蛄械膶?duì)稱軸一般距轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)16～24bp。

兩類終止子的不同點(diǎn)是：不依賴ρ因子的終止子的回文序列中富含GC堿基對(duì)，在回文序列的下游方向又常有6～8個(gè)AT堿基對(duì)(在模板鏈上為A、在mRNA上為U)；而依賴ρ因子終止子中回文序列的GC對(duì)含量較少。在回文序列下游方向的序列沒(méi)有固定特征，其AT對(duì)含量比前一種終止子低。