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鹿明生物采用LCMSMS技術(shù)進行蛋白膠點、膠條鑒定，并對膠內(nèi)酶解法進行系列優(yōu)化，通過與數(shù)據(jù)庫的檢索，推斷得到與之可能性最高的匹配蛋白。

送樣要求：蛋白干粉，膠條封存于ep管內(nèi)，4℃（冰袋）運輸；溶液樣本干冰運送

膠條鑒定時間：約10個工作日左右（具體時間以合同為準(zhǔn)）

溶液鑒定時間：約15個工作日左右（具體時間以合同為準(zhǔn)）

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Nature Plants | 濟南大學(xué)、中科院植物所、清華大學(xué)合作解析潮間帶大型綠藻光系統(tǒng)I-捕光天線I復(fù)合物結(jié)構(gòu)

2019年3月8日，濟南大學(xué)、中科院植物所與清華大學(xué)合作在Nature Plants發(fā)表了題為 Structure of a green algal photosystem I in complex with a large number of light-harvesting complex I subunits 的研究長文，報道了一種潮間帶大型綠藻（假根羽藻，Bryopsis Corticulans）PSI-LHCI 超分子復(fù)合物的3.49? 分辨率的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)，這是繼高等植物之后，在 PSI 結(jié)構(gòu)與功能研究領(lǐng)域取得的又一重大突破。

這一研究工作填補了到目前為止未被報道的綠藻 PSI-LHCI 較高分辨率結(jié)構(gòu)的空白，進一步完善了對光合生物進化過程中 PSI 結(jié)構(gòu)變化趨勢的理解；從進化與光環(huán)境適應(yīng)的角度揭示了捕光天線復(fù)合物的捕光設(shè)計機理；為揭示綠藻光合膜蛋白 PSI-LHCI 高效吸能與傳能的機理奠定了堅實的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)；為人工模擬光合作用機理，為指導(dǎo)設(shè)計作物與提高植物的光能利用效率提供了新的理論依據(jù)和新思路。

濟南大學(xué)秦曉春教授、清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院五年級博士生皮雄為該論文的共同第一作者，中國科學(xué)院植物研究所匡廷云院士、清華大學(xué)隋森芳院士為該論文的共同通訊作者。本項目得到了中國科技部重點研發(fā)計劃、清華大學(xué)膜生物學(xué)國家重點實驗室開放項目、北京市結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心（清華），國家自然科學(xué)基金委優(yōu)青項目、濟南大學(xué)高層次人才計劃、山東省青年泰山學(xué)者計劃的支持。國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心（北京）清華大學(xué)冷凍電鏡平臺和清華大學(xué)高性能計算平臺分別為該研究的數(shù)據(jù)收集和數(shù)據(jù)處理提供了支持。質(zhì)譜測序由上海鹿明生物科技有限公司協(xié)助完成。

1、如何來判定哪些蛋白是和自己研究相關(guān)的蛋白，挑選什么樣的蛋白來進行后期的驗證實驗？
需要研究人員根據(jù)自己研究的相關(guān)生物學(xué)背景，再結(jié)合生物信息學(xué)分析的結(jié)果，以及查看相關(guān)的文獻資料來確認(rèn)哪些蛋白可以用于后續(xù)深入的研究。
后期的蛋白驗證實驗，一般情況下是根據(jù)客戶的需要，結(jié)合課題本身，在所篩選到的差異的蛋白中，找到自己關(guān)注的蛋白。并且在挑選的時候盡量挑蛋白可信度高的、差異變化較明顯的蛋白。
2、做蛋白鑒定時，檢索時為什么同一個編號對應(yīng)了很多蛋白質(zhì)？

因為一個蛋白家族中常常含有多個同源性很高的蛋白質(zhì)，這些蛋白質(zhì)被酶切之后，很可能會產(chǎn)生很多相同的肽段，軟件在進行定性分析時，就會將這些肽段均歸于得分最高的那種蛋白質(zhì)，其他同源蛋白不計分，并且這些同源蛋白都采用同一編號。

3、蛋白質(zhì)譜鑒定不成功一般有哪些因素?

質(zhì)譜鑒定不成功主要可以分為兩類，一類是質(zhì)譜效果不好，一類是沒有可參考的蛋白數(shù)據(jù)庫，質(zhì)譜效果不好的原因又可以細(xì)分為蛋白點太淡以至于蛋白含量過低（常見銀染的點）、蛋白酶解及質(zhì)譜操作失誤等，要避免這些因素需要盡量取顏色深一些的蛋白點，并且取的蛋白點面積需要適當(dāng)大一些，對于某些很小但很清晰的蛋白點，取點的時候可適當(dāng)選擇孔徑大一些的槍頭，把邊上空白處適當(dāng)取到一些也不要緊，避免取點混入其他的蛋白點。其次，由于沒有合適的數(shù)據(jù)庫導(dǎo)致的鑒定效果較差，可以通過更換范圍更大的數(shù)據(jù)庫、近緣物種數(shù)據(jù)庫、采用相關(guān)研究物種的蛋白、EST數(shù)據(jù)庫等構(gòu)建本地數(shù)據(jù)庫的方式進行解決。

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