細(xì)菌生物被膜培養(yǎng)方法與技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)
以下生物被膜培養(yǎng)方法與技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)均以銅綠假單胞菌為模式菌株撰寫,其他菌種培養(yǎng)以及實(shí)驗(yàn)條件可按需求適當(dāng)調(diào)整。
銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是一種常見的革蘭氏陰性條件致病菌,在正常人皮膚、呼吸道、腸道以及多種自然環(huán)境如水、土壤中廣泛分布。此菌為桿狀單鞭毛形態(tài),適宜生長(zhǎng)溫度為25-37℃,在42℃也可生長(zhǎng),于LB培養(yǎng)基上呈青綠色圓形菌落且極易附著在不同基質(zhì)表面形成生物被膜。銅綠假單胞菌是醫(yī)院內(nèi)感染的主要致病菌之一,可在免疫力低下的患者不同部位形成生物被膜引起長(zhǎng)期慢性感染,包括燒傷傷口感染、呼吸道感染和尿路感染等,并可引發(fā)菌血癥和敗血癥等致命并發(fā)癥。此菌對(duì)多種抗生素耐藥,并且耐藥機(jī)制非常復(fù)雜,包括形成生物被膜、加強(qiáng)外排泵系統(tǒng)、改變細(xì)胞膜通透性與藥物作用靶點(diǎn)、以及分泌抗菌酶等。銅綠假單胞菌生物被膜的形成機(jī)制也相當(dāng)復(fù)雜,例如通過過量分泌胞外多糖、積累胞外DNA、降低運(yùn)動(dòng)能力、調(diào)節(jié)群體感應(yīng)系統(tǒng)等。作為研究生物被膜的模式菌株,銅綠假單胞菌早已被廣泛應(yīng)用于構(gòu)建生物被膜、檢測(cè)其耐藥性并開發(fā)用藥方案的研究中,是以本指南以銅綠假單胞菌為模式菌株撰寫,其他菌種的培養(yǎng)及實(shí)驗(yàn)條件可按需適當(dāng)調(diào)整以達(dá)到最佳實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
4.1 體外靜態(tài)生物被膜培養(yǎng)
本指南囊括四種常用的體外靜態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法,包括孔板培養(yǎng)法、玻璃珠培養(yǎng)法、玻片培養(yǎng)法和Peg-lid培養(yǎng)法。
(1)孔板培養(yǎng)法(4.1.1)將稀釋菌液在96孔板或24孔板中培養(yǎng),生物被膜附著于孔壁上,移除懸浮液并洗脫浮游菌體可得到生物被膜用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)??装迮囵B(yǎng)法一般用于檢測(cè)菌種生物被膜形成能力、生物被膜定量、生物被膜耐藥性和藥物最小抑菌濃度等實(shí)驗(yàn)。此培養(yǎng)法可與多種染色法結(jié)合用于定量生物被膜,培養(yǎng)出的生物被膜結(jié)構(gòu)可用不同顯微鏡觀察。此培養(yǎng)法具有通量高、培養(yǎng)時(shí)間短和操作簡(jiǎn)單等優(yōu)勢(shì),但培養(yǎng)的生物被膜厚度與硬度較低,浮游菌體不易洗脫造成平行間差異較大。
(2)玻璃珠培養(yǎng)法(4.1.2)在24孔板中將玻璃珠置于稀釋菌液內(nèi)培養(yǎng),生物被膜附著于玻璃珠表面,洗脫浮游菌體可得到生物被膜用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。此培養(yǎng)法與孔板培養(yǎng)法類似,一般用于檢測(cè)菌種生物被膜形成能力、生物被膜定量、生物被膜耐藥性和藥物最小抑菌濃度等試驗(yàn)。此培養(yǎng)法可與多種染色法結(jié)合用于定量生物被膜,但不易在顯微鏡下觀察。此培養(yǎng)法具有通量高、培養(yǎng)時(shí)間短等優(yōu)勢(shì),但操作略復(fù)雜。此方法培養(yǎng)的生物被膜厚度與硬度較高,浮游菌體較易清洗,平行間差異較小。
(3)玻片培養(yǎng)法(4.1.3)將玻片插入菌液培養(yǎng),生物被膜附著于玻片表面,去除撥片并洗脫浮游菌體得到生物被膜用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。此方法一般用于檢測(cè)菌種生物被膜形成能力、觀察生物被膜結(jié)構(gòu)與形態(tài),可與多種染色方法和多種顯微鏡結(jié)合使用觀測(cè)生物被膜構(gòu)態(tài)。此方法通量高、培養(yǎng)時(shí)間短,但操作略復(fù)雜。此方法培養(yǎng)的生物被膜量較大、厚度與硬度高,浮游菌體易清洗,平行間差異較小。
(4)Peg-lid培養(yǎng)法(4.1.4)將帶有凸起楔子(peg)的96孔板蓋置于裝有菌液的96孔板中培養(yǎng),生物被膜附著于peg中下端,取下蓋子并洗脫peg上的浮游菌體可得到生物被膜用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。此方法與孔板培養(yǎng)法類似,一般用于檢測(cè)菌種生物被膜形成能力、生物被膜定量、生物被膜耐藥性和藥物最小抑菌濃度等試驗(yàn)。此培養(yǎng)法可與多種染色法結(jié)合用于定量生物被膜,但培養(yǎng)出的生物被膜由于在楔子頂端,不易于顯微鏡觀察。此培養(yǎng)法具有通量高、培養(yǎng)時(shí)間短和操作簡(jiǎn)單等優(yōu)勢(shì),培養(yǎng)的生物被膜厚度與硬度較高,浮游菌體較易洗脫、平行間差異較小。
每種培養(yǎng)與觀測(cè)方法細(xì)節(jié)請(qǐng)見下文。
4.1.1 孔板培養(yǎng)法
適用范圍:孔板生物被膜培養(yǎng)法通常適用于以下場(chǎng)景:(1)需要檢測(cè)不同菌種(野生菌種和突變菌種)間生物被膜形成能力,(2)需要檢測(cè)不同菌株在生物被膜狀態(tài)下對(duì)藥物的敏感/耐受性。針對(duì)孔板培養(yǎng)的生物被膜的分析方法主要包括:生物被膜定量(章節(jié)5.1.2a)、生物被膜耐藥性和藥物最小抑菌濃度(章節(jié)6.1)。以下示意裝置和操作均以銅綠假單胞菌(PA)為模式菌株,在耗氧培養(yǎng)條件下進(jìn)行示例:
圖1. 體外靜態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法(孔板培養(yǎng)法)
4.1.1.1 實(shí)驗(yàn)材料:
a. 無菌96孔板(或24孔板, Nest/Corning);
b. 無菌儲(chǔ)液器;
c. 100 μL排槍移液器(或1 mL移液器);
d. 15 mL無菌搖菌管;
e. 100 μL(或1 mL)移液器槍頭;
f. LB培養(yǎng)基(可按需使用其他培養(yǎng)基);
g. 所需菌株;
h. 廢液桶;
i. 75%酒精;
j. 無菌ddH2O;
k. 無菌生理鹽水。
4.1.1.2 培養(yǎng)步驟【附錄以protocol/SOP模式進(jìn)行詳細(xì)闡述】
首先將目標(biāo)菌株接種至LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜。在無菌操作臺(tái)中,用新鮮培養(yǎng)基將菌液按一定比例稀釋,隨后將稀釋好的菌液傾倒入無菌儲(chǔ)液器,再用排槍移液器將稀釋菌液加入96孔板或24孔板孔洞中,并置于所需溫度下靜置培養(yǎng)生物被膜。實(shí)驗(yàn)菌種和對(duì)照菌種均按照附錄Xa的培養(yǎng)步驟進(jìn)行接種、培養(yǎng)(附錄Xa),隨后對(duì)生物被膜進(jìn)行分析(章節(jié)5)。
4.1.1.3 技術(shù)要點(diǎn)
a. 所有操作須嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作流程,在操作過程中注意須使用滅菌器具并用酒精消毒操作臺(tái)以及所使用的器具,避免交叉污染;
b. 在將菌液加入孔板前,輕輕搖晃儲(chǔ)液器將菌液混合均勻,并用排槍反復(fù)輕輕吹打菌液,以減小實(shí)驗(yàn)誤差;
c. 孔板培養(yǎng)生物被膜需保證培養(yǎng)后孔洞內(nèi)剩余菌液體積基本一致,培養(yǎng)時(shí)需用透氣封口膜密封孔板防止液體蒸發(fā);
d. 移除廢液以及清洗生物被膜時(shí)須注意不可用槍頭觸碰生物被膜,以保證生物被膜完整性。
4.1.2玻璃珠培養(yǎng)法
適用范圍:玻璃珠生物被膜培養(yǎng)法通常適用于以下場(chǎng)景:(1)用于循環(huán)培養(yǎng)生物被膜進(jìn)行壓力條件進(jìn)化實(shí)驗(yàn),(2)需要檢測(cè)不同菌株在生物被膜狀態(tài)下對(duì)藥物的敏感/耐受性。針對(duì)玻璃珠培養(yǎng)的生物被膜的分析方法主要為:CFU計(jì)數(shù)法(章節(jié)5.3.2b)。以下示意裝置和操作均以銅綠假單胞菌(PA)為模式菌株,在耗氧培養(yǎng)條件下進(jìn)行示例:
圖2. 體外靜態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法(玻璃珠培養(yǎng)法)
4.1.2.1 實(shí)驗(yàn)材料:
a. 無菌24孔板;
b. 無菌儲(chǔ)液器;
c. 1 mL移液器
d. 15 mL無菌搖菌管;
e. 1 mL移液器槍頭;
f. LB培養(yǎng)基(可按需使用其他培養(yǎng)基);
g. 無菌ddH2O(可按需使用PBS溶液或生理鹽水);
h. 所需菌株;
i. 廢液桶;
j. 75%酒精;
k. 鑷子;
l. 3-5 mm玻璃珠。
4.1.2.2 培養(yǎng)步驟【附錄以protocol/SOP模式進(jìn)行詳細(xì)闡述】
首先將目標(biāo)菌株接種至LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜,用新鮮培養(yǎng)基將菌液按一定比例稀釋,隨后將稀釋好的菌液轉(zhuǎn)移至24孔板孔洞中,并加入兩顆無菌玻璃珠,37℃ 100 rpm轉(zhuǎn)速搖晃培養(yǎng)過夜。實(shí)驗(yàn)菌種和對(duì)照菌種均按照附錄Xa的培養(yǎng)步驟進(jìn)行接種、培養(yǎng)(附錄Xb),隨后對(duì)生物被膜進(jìn)行分析(章節(jié)5)。
4.1.2.3 技術(shù)要點(diǎn)
a. 所有操作須嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作流程,在操作過程中注意須使用滅菌器具并用酒精消毒操作臺(tái)以及所使用的器具,避免交叉污染;
b. 在將菌液加入孔板前,輕輕搖晃儲(chǔ)液器將菌液混合均勻,并用移液器反復(fù)輕輕吹打菌液,以減小實(shí)驗(yàn)誤差;
c. 孔洞內(nèi)菌液不可過多,以免搖晃培養(yǎng)時(shí)菌液濺出造成交叉污染;
d. 用無菌鑷子轉(zhuǎn)移玻璃珠時(shí),需盡量減少鑷子與玻璃珠接觸面,以保證生物被膜完整性;
e. 孔板培養(yǎng)生物被膜需保證培養(yǎng)后孔洞內(nèi)剩余菌液體積基本一致,培養(yǎng)時(shí)需用透氣封口膜密封孔板防止液體蒸發(fā)。
4.1.3 玻片培養(yǎng)法
適用范圍:玻片生物被膜培養(yǎng)法通常適用于以下場(chǎng)景:(1)需要檢測(cè)不同菌種(野生菌種和突變菌種)間生物被膜形成能力,(2)需要檢測(cè)不同菌株在生物被膜狀態(tài)下對(duì)藥物的敏感/耐受性。針對(duì)玻片培養(yǎng)的生物被膜的分析方法主要包括:生物被膜定量(章節(jié)5.1.2c)和生物被膜耐藥性(章節(jié)5.3.2c)。以下示意裝置和操作均以銅綠假單胞菌(PA)為模式菌株,在耗氧培養(yǎng)條件下進(jìn)行示例:
圖3. 體外靜態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法(玻片培養(yǎng)法)
4.1.3.1 實(shí)驗(yàn)材料:
a. 無菌培養(yǎng)皿(靜置培養(yǎng)需準(zhǔn)備6孔板);
b. 15 mL無菌搖菌管;
c. LB培養(yǎng)基(可按需使用其他培養(yǎng)基);
d. 無菌ddH2O(可按需使用PBS溶液或生理鹽水)
e. 所需菌株;
f. 廢液桶;
g. 75%酒精;
h. 鑷子;
i. 載玻片。
4.1.3.2 培養(yǎng)步驟【附錄以protocol/SOP模式進(jìn)行詳細(xì)闡述】
首先將目標(biāo)菌株接種至LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜,用新鮮培養(yǎng)基將菌液按一定比例稀釋,隨后將稀釋好的菌液轉(zhuǎn)移至培養(yǎng)皿,并加入無菌載玻片,37 ℃ 100 rpm轉(zhuǎn)速搖晃培養(yǎng)過夜。實(shí)驗(yàn)菌種和對(duì)照菌種均按照附錄Xa的培養(yǎng)步驟進(jìn)行接種、培養(yǎng)(附錄Xc),隨后對(duì)生物被膜進(jìn)行分析(章節(jié)5)。
4.1.3.3 技術(shù)要點(diǎn)
a. 所有操作須嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作流程,在操作過程中注意須使用滅菌器具并用酒精消毒操作臺(tái)以及所使用的器具,避免交叉污染;
b. 培養(yǎng)皿內(nèi)菌液不可過多,以免搖晃培養(yǎng)時(shí)菌液濺出造成污染;
c. 用無菌鑷子轉(zhuǎn)移載玻片時(shí),需盡量減少鑷子與玻璃珠接觸面,以保證生物被膜完整性;
d. 搖晃培養(yǎng)時(shí)需用透氣封口膜密封培養(yǎng)皿防止液體蒸發(fā)。
4.1.4 Peg-lid 培養(yǎng)法
適用范圍:Peg-lid生物被膜培養(yǎng)法通常適用于以下場(chǎng)景:(1)需要檢測(cè)不同菌種(野生菌種和突變菌種)間生物被膜形成能力,(2)需要檢測(cè)不同菌株在生物被膜狀態(tài)下對(duì)藥物的敏感/耐受性。針對(duì)Peg-lid培養(yǎng)的生物被膜的分析方法主要包括:生物被膜定量(章節(jié)5.1.2c)和生物被膜耐藥性(章節(jié)5.3.2c)。以下示意裝置和操作均以銅綠假單胞菌(PA)為模式菌株,在耗氧培養(yǎng)條件下進(jìn)行示例:
圖4. 體外靜態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法(peg lid培養(yǎng)法)
4.1.4.1 實(shí)驗(yàn)材料:
a. 96孔板;
b. Peg lid蓋子(見附錄圖三);
c. 無菌儲(chǔ)液器;
d. 100 μL排槍移液器;
e. 15 mL無菌搖菌管;
f. 100 μL(或1 mL)移液器槍頭;
g. LB培養(yǎng)基(可按需使用其他培養(yǎng)基);
h. 所需菌株;
i. 廢液桶;
j. 75%酒精;
k. 無菌ddH2O(可按需使用PBS溶液或生理鹽水);
l. 無菌生理鹽水。
4.1.4.2 培養(yǎng)步驟【附錄以protocol/SOP模式進(jìn)行詳細(xì)闡述】
首先將目標(biāo)菌株接種至LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜,用新鮮培養(yǎng)基將菌液按一定比例稀釋,隨后將稀釋好的菌液轉(zhuǎn)移至96孔板中,再將peg lid小心蓋入菌液中。37℃ 100 rpm轉(zhuǎn)速搖晃培養(yǎng)過夜。實(shí)驗(yàn)菌種和對(duì)照菌種均按照附錄Xa的培養(yǎng)步驟進(jìn)行接種、培養(yǎng)(附錄Xd),隨后對(duì)生物被膜進(jìn)行分析(章節(jié)5)。
4.1.4.3 技術(shù)要點(diǎn)
a. 所有操作須嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作流程,在操作過程中注意須使用滅菌器具并用酒精消毒操作臺(tái)以及所使用的器具,避免交叉污染;
b. 在將菌液加入孔板前,輕輕搖晃儲(chǔ)液器將菌液混合均勻,并用排槍反復(fù)輕輕吹打菌液,以減小實(shí)驗(yàn)誤差;
c. 孔洞內(nèi)菌液不可過多,以免置入peg lid或震蕩培養(yǎng)時(shí)菌液濺出造成污染;
d. 需保證培養(yǎng)后孔洞內(nèi)剩余菌液體積基本一致,培養(yǎng)時(shí)需用透氣封口膜密封孔板防止液體蒸發(fā);
e. 移除廢液以及清洗生物被膜時(shí)須注意不可觸碰生物被膜,以保證生物被膜完整性。
4.2 體外動(dòng)態(tài)生物被膜培養(yǎng)
本指南囊括兩種常用的體外靜態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法,包括管式培養(yǎng)法和池式培養(yǎng)法,詳細(xì)介紹如下:
(1)管式培養(yǎng)法將菌液注入硅膠管內(nèi)靜置附著后,將培養(yǎng)基以勻速注入硅膠管,流動(dòng)培養(yǎng)生物被膜,生物被膜附著于管壁上。此方法一般應(yīng)用于對(duì)生物被膜樣品需求量大的實(shí)驗(yàn),如生物被膜樣品收集,胞外多糖收集生物轉(zhuǎn)化(biotransformation)等。此方法可形成大量生物被膜,生物被膜結(jié)構(gòu)厚,通量較高,但培養(yǎng)時(shí)間較長(zhǎng),操作較復(fù)雜,并不易用顯微鏡觀察生物被膜結(jié)構(gòu)。
(2)池式培養(yǎng)法將菌液注入培養(yǎng)池通道內(nèi),翻轉(zhuǎn)靜置待細(xì)菌附著與蓋子上之后,將培養(yǎng)基以勻速注入培養(yǎng)通道,流動(dòng)培養(yǎng)生物被膜,生物被膜附著于三通道池蓋上。此方法一般應(yīng)用于生物被膜形態(tài)觀察、藥物對(duì)生物被膜形態(tài)的影響等實(shí)驗(yàn),此方法形成生物被膜形態(tài)與結(jié)構(gòu)完整,可結(jié)合有熒光標(biāo)記的菌株或不同染色法,直接在顯微鏡下觀測(cè)生物被膜形態(tài)與結(jié)構(gòu),但通量較低,操作復(fù)雜,培養(yǎng)時(shí)間較長(zhǎng)。
4.2.1 管式培養(yǎng)法(tubing-biofilm)
適用范圍:管式生物被膜培養(yǎng)法通常適用于以下場(chǎng)景:(1)需要模擬管道內(nèi)生物被膜生長(zhǎng)環(huán)境的研究,(2)需要相對(duì)大量生物被膜樣品的研究,(3)生物被膜對(duì)藥物/化合物代謝(biotransformation)的相關(guān)研究等。針對(duì)管式培養(yǎng)的生物被膜的分析方法主要包括:干重/濕重分析(章節(jié)5.4)、基因組/轉(zhuǎn)錄組/蛋白組提取和測(cè)序分析、電子顯微鏡觀察(章節(jié)5.7)、氧氣探針/化合物探針監(jiān)測(cè)等。以下示意裝置和操作均以銅綠假單胞菌(PA)為模式菌株,在耗氧培養(yǎng)條件下進(jìn)行示例:
管式生物被膜培養(yǎng)法具有較高通量,可以一次性培養(yǎng)多通道生物被膜樣品;該方法能夠一次性產(chǎn)出大量生物被膜樣品,常用于干重/濕重分析、基因樣本提取,EPS等代謝產(chǎn)物提取、電子顯微鏡觀察和氧氣探針/化學(xué)探針觀察等。
圖5. 體外動(dòng)態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法(管式培養(yǎng)法)
4.2.1.1實(shí)驗(yàn)材料:
a. 15 mL無菌搖菌管;
b. 長(zhǎng)50 cm,內(nèi)直徑1.0 mm 硅膠管(潤(rùn)澤);
c. 長(zhǎng)2520 cm,內(nèi)直徑 1.0 mm 硅膠泵管(潤(rùn)澤);
d. 長(zhǎng)15 cm,內(nèi)直徑1.0 mm 硅膠管(潤(rùn)澤);
e. 長(zhǎng)10 cm,內(nèi)直徑3.2 mm 硅膠管(潤(rùn)澤);
f. 長(zhǎng)30 cm,內(nèi)直徑 1.0 mm 硅膠泵管(潤(rùn)澤);
g. 等徑直通接頭(潤(rùn)澤);
h. 變徑直通接頭(潤(rùn)澤);
i. 魯爾接頭(潤(rùn)澤);
j. 2個(gè)2L玻璃培養(yǎng)瓶;
k. 10% LB培養(yǎng)基(可按需使用其他培養(yǎng)基);
l. 過濾器(過濾孔0.22 μm);
m. 蠕動(dòng)泵(aperistaltic pump,MasterFlex);
n. 所需菌株;
o. 醫(yī)用尖銳物處理容器;
p. 75%酒精;
q. 鑷子;
r. 5 mL及1 mL無菌針管;
s. 無菌針頭;
t. 移液器;
u. 無菌移液管。
4.2.1.2培養(yǎng)步驟【附錄以protocol/SOP模式進(jìn)行詳細(xì)闡述】
首先將裝有培養(yǎng)基的玻璃培養(yǎng)瓶、硅膠管、除泡器和鑷子在121℃高溫高壓滅菌15分鐘,取出并將硅膠管、除泡器和鑷子干燥備用。如圖一所示,在無菌操作臺(tái)中按順序用安裝雙向接頭的硅膠管b連接裝有培養(yǎng)基的玻璃培養(yǎng)瓶、無阻泵、過濾器、硅膠管c、d、e、f,2L廢液罐,同個(gè)裝置內(nèi)至少三個(gè)平行(圖內(nèi)展示一個(gè)平行),將整個(gè)系統(tǒng)置于恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)。
將目標(biāo)菌株接種至適當(dāng)體積的LB培養(yǎng)基中,在所需溫度下200 rpm搖晃培養(yǎng)過夜。在無菌操作臺(tái)中,用新鮮LB培養(yǎng)基將菌液稀釋至OD600nm=0.1,用無菌針管吸入2 mL稀釋菌液,并將稀釋菌液分別注入硅膠管b平行裝置中,用硅膠封口后靜置培養(yǎng)2小時(shí)使細(xì)菌細(xì)胞粘附于管壁, 用10% LB流動(dòng)培養(yǎng)基培養(yǎng)3至7天,建立生物被膜。
首先將生物被膜管式培養(yǎng)裝置進(jìn)行滅菌和組裝,在用藥組的培養(yǎng)基玻璃瓶中加入工作濃度的目標(biāo)抗生素并混合均勻;在陽(yáng)性對(duì)照組的培養(yǎng)基玻璃瓶中加入已知具有抑菌抑生物被膜濃度的粘菌素colistin并混合均勻;在陰性對(duì)照組的培養(yǎng)基玻璃瓶中加入等體積的用藥組抗生素的溶劑并混合均勻。用藥組、陽(yáng)性對(duì)照組和陰性對(duì)照組均按照附錄X的培養(yǎng)步驟進(jìn)行接種、培養(yǎng)(附錄Xe),后收集生物被膜進(jìn)行觀察。
4.2.1.3技術(shù)要點(diǎn)
a. 所有操作須嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作流程,在操作過程中注意須使用滅菌器具并用酒精消毒操作臺(tái)以及所使用的器具,避免交叉污染;
b. 使用針管與針頭吸取菌液后,針頭不可朝向操作人,不可蓋回針頭蓋子,以免誤傷操作人員;
c. 將使用過的針管與針頭丟棄入醫(yī)用尖銳物處理容器統(tǒng)一處理,避免誤傷操作人員;
d. 保證無阻泵運(yùn)行速度一致,避免液體回流造成污染;
e. 保證硅膠管管壁厚度適宜,造成管壁破裂,影響生物被膜形成;
f. 在培養(yǎng)過程中如需添加培養(yǎng)基,須用酒精消毒瓶口與鄰近裝置表面,避免污染;
g. 培養(yǎng)瓶口須用透氣封口膜密封防止培養(yǎng)基蒸發(fā)。
4.2.2 池式培養(yǎng)法(flow-cell biofilm)
適用范圍:池式生物被膜培養(yǎng)法通常適用于以下場(chǎng)景:(1)需要實(shí)時(shí)觀察生物被膜形態(tài)的相關(guān)研究,(2)需要實(shí)時(shí)觀察生物被膜中標(biāo)記蛋白/基因表達(dá)及分布的相關(guān)研究,(3)需要實(shí)時(shí)觀察生物被膜群落中不同菌種相對(duì)位置關(guān)系的研究等。針對(duì)池式培養(yǎng)的生物被膜的分析方法主要包括:死活菌細(xì)胞染色法(章節(jié)5.2)、激光共聚焦熒光顯微鏡觀測(cè)法(章節(jié)5.6)、3D熒光成像定性定量法(章節(jié)5.5)等。以下示意裝置和操作均以銅綠假單胞菌(PA)為模式菌株,在耗氧培養(yǎng)條件下進(jìn)行示例:池式生物被膜培養(yǎng)法通常適用于以下場(chǎng)景:(1)
圖6. 體外動(dòng)態(tài)生物被膜培養(yǎng)方法(池式培養(yǎng)法)
4.2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料:
a. 15 mL無菌搖菌管;
b. 三通道培養(yǎng)池(3-channel flow-cell)與樹脂蓋;
c. 蓋玻片;
d. 硅膠膠水;
e. 長(zhǎng)50 cm,內(nèi)直徑1.0 mm硅膠管;
f. 長(zhǎng)25 cm長(zhǎng)20 cm,內(nèi)直徑 1.0 mm硅膠泵管,雙端安裝;
g. 長(zhǎng)15 cm,內(nèi)直徑1.0 mm硅膠管;
h. 長(zhǎng)30 cm,內(nèi)直徑1.0 mm硅膠泵管;
i. 等徑直通接頭;
j. 魯爾接頭;
k. 2個(gè)2 L玻璃培養(yǎng)瓶;
l. 10% LB培養(yǎng)基(可按需使用其他培養(yǎng)基);
m. 過濾器(過濾孔0.22 μm);
n. 蠕動(dòng)泵(aperistaltic pump);
o. 所需菌株;
p. 醫(yī)用尖銳物處理容器;
q. 75%酒精;
r. 鑷子;
s. 5 mL及1 mL無菌針管;
t. 無菌針頭;
u. 移液器;
v. 無菌移液管。
4.2.2.2 培養(yǎng)步驟【附錄以protocol/SOP模式進(jìn)行詳細(xì)闡述】
首先將生物被膜池式培養(yǎng)裝置進(jìn)行滅菌和組裝,在用藥組的培養(yǎng)基玻璃瓶中加入工作濃度的目標(biāo)抗生素并混合均勻;在陽(yáng)性對(duì)照組的培養(yǎng)基玻璃瓶中加入已知具有抑菌抑生物被膜濃度的粘菌素colistin并混合均勻;在陰性對(duì)照組的培養(yǎng)基玻璃瓶中加入等體積的用藥組抗生素的溶劑并混合均勻。用藥組、陽(yáng)性對(duì)照組和陰性對(duì)照組均按照附錄X的培養(yǎng)步驟進(jìn)行接種、培養(yǎng)(附錄Xf),后收集生物被膜進(jìn)行觀察。
4.2.2.3 技術(shù)要點(diǎn)
a. 所有操作須嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作流程,在操作過程中注意須使用滅菌器具并用酒精消毒操作臺(tái)以及所使用的器具,避免交叉污染;
b. 使用針管與針頭吸取菌液后,針頭不可朝向操作人,不可蓋回針頭蓋子,以免誤傷操作人員;
c. 將使用過的針管與針頭丟棄入醫(yī)用尖銳物處理容器統(tǒng)一處理,避免誤傷操作人員;
d. 保證無阻泵運(yùn)行速度一致,避免液體回流造成污染;
e. 保證培養(yǎng)池翻轉(zhuǎn)狀態(tài),以免影響生物被膜形成;
f. 黏結(jié)培養(yǎng)池與池蓋時(shí)須小心不可將池蓋壓破,并須保證培養(yǎng)池與池蓋完全密封,避免菌液與培養(yǎng)基溢出造成污染;
g. 保證培養(yǎng)池所有通道暢通,避免堵塞造成液體回流與污染;
h. 在培養(yǎng)過程中如需添加培養(yǎng)基,須用酒精消毒瓶口與鄰近裝置表面,避免污染;
i. 培養(yǎng)瓶口須用透氣封口膜密封防止培養(yǎng)基蒸發(fā)。