本國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了從土壤樣品中直接提取 DNA 的方法,以使用基于 PCR 的技術(shù)分析土壤細(xì)菌群落的整體結(jié)構(gòu)和豐度。
該方法主要適用于農(nóng)業(yè)和森林土壤。
該方法可能不適用于富含有機(jī)質(zhì)的土壤(例如泥炭土)或被有機(jī)污染物或重金屬嚴(yán)重污染的土壤。
從土壤樣本中直接提取 DNA 可以為微生物群落的豐富度和結(jié)構(gòu)提供獨(dú)特的見解,而微生物群落是估計(jì)土壤微生物群生物多樣性的關(guān)鍵參數(shù)。
基于土壤 DNA PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))擴(kuò)增的分子方法構(gòu)成了一個(gè)有前景的領(lǐng)域,并且可以在不久的將來為監(jiān)測(cè)土壤環(huán)境微生物群的常規(guī)工具的開發(fā)做出貢獻(xiàn)。
該方法的使用者應(yīng)該意識(shí)到,盡管進(jìn)行 DNA 提取程序的土壤經(jīng)過了徹底的篩分(2 毫米篩網(wǎng),5.1 中描述的程序),但植物殘留物仍然可能保留在土壤樣品中,因此,植物 DNA 的痕跡可能會(huì)殘留在土壤樣品中。
污染土壤 DNA 提取物。